特遣队的星舰在宇宙中巡逻，舰体的修复工作因暗物质残留而停滞。阿依娜的警报声再次响起：“检测到空间折叠现象！坐标...正是暗物质碎片聚合点！”星舰的导航系统突然失控，自动驶向那个危险区域。队员们握紧武器，准备迎接未知的挑战。

在宇宙的黑暗角落，暗物质碎片汇聚成一座巨大的晶体城堡，城堡的每一块晶体都映照着被毁灭文明的惨状。城堡中央，一个身披黑袍的身影缓缓起身，他的面容被阴影笼罩，只露出一双闪烁着猩红光芒的眼睛。他的声音低沉而冰冷：“愚蠢的文明，以为战胜了分身就能高枕无忧？真正的黑暗，现在才开始。”随着他的挥手，晶体城堡爆发出强大的能量波动，无数暗物质生物从晶体中涌出，向着各个文明发起攻击。

文明的守护者们再次集结，然而这次，他们面对的不仅是强大的敌人，还有来自内部的危机——暗物质的侵蚀让部分文明的信念开始动摇，怀疑与恐惧在各个种族中蔓延。队长看着眼前的困境，高举文明之剑，大声喊道：“我们已经战胜过一次黑暗！只要团结一心，就没有无法克服的困难！为了文明的未来，战斗！”一场关乎宇宙存亡的终极之战，即将再次拉开帷幕……