伊璇带着新生的双色世界树踏上寻找“遗憾能量”的旅程。在一颗即将被暗物质吞噬的星球上，她见证了文明最后的艺术家将毕生心血化作光雕，那光芒中饱含着对未完成作品的遗憾。世界树的暗紫色枝条贪婪地吸收光芒，而翠绿枝条却将其净化成对抗暗种的力量。

阿岚与银色面具孩童潜入暗种的程序空间，发现暗种的核心是一个由无数同心圆组成的“命运转盘”，每个圆代表着一种文明的演化路径。他们试图篡改转盘的运行逻辑，却触发了更高级存在的防御机制，无数暗紫色数据洪流将他们淹没。

洛凛带领学员们前往“勇气能量”的诞生地——一片被暗紫色藤蔓包围的战场。在那里，无数无名战士明知必死，仍高举武器冲向藤蔓。学员们被勇气感染，将自身信念与战士们的精神融合，形成一道能暂时击退藤蔓的金色屏障。

雷掣在被腐蚀的星环机械中植入病毒程序，试图夺回控制权。当他的意识再次潜入暗物质网络，发现暗种的根系已触及宇宙的本源能量。千钧一发之际，他引爆部分星环，用爆炸产生的乱流干扰暗种的能量传输。

当四种能量逐渐集齐，守护者们向暗种核心发起总攻。但在接近核心时，他们遭遇了由观测者的观测者投影而成的“维度守卫”。这些守卫的力量超越物理法则，每一次攻击都能改写空间规则。而在暗种核心深处，林羽的意识正与暗种的意志激烈对抗，他的星尘光芒越来越弱，留给守护者们的时间，已经不多了……