希望星云的光芒驱散遗忘病阴霾后，宇宙迎来了前所未有的共生纪元。不同维度的文明开始打破壁垒，机械族与能量体共同研发出能修复时空裂缝的“共生纳米体”，魔法文明与科技文明联手建立了跨星系生态平衡系统。然而，当无界医盟以为危机彻底终结时，一场源于生命本质的危机正在量子海洋深处酝酿。

各个星系的生命监测站突然发出警报：所有碳基、硅基乃至能量态生命体的基因链，都出现了相同的异常波动——基因片段中开始自发插入一段未知的“归零代码”。白曦的量子实验室里，全息投影中跳动的基因图谱如同被病毒感染的程序，疯狂闪烁着红色警告。“这不是自然变异，”她的声音带着颤意，“这段代码正在系统性地删除生命体的自主意识模块，就像...要将所有生命格式化。”

秦溯在青山村的医道传承院感知到异动时，老槐树的年轮中渗出金色液体，在空中凝结成初代神农的虚影。虚影手中捧着一株散发着量子光芒的草药，叶片上流转着宇宙诞生至今的所有生命形态：“万生同脉，祸福相依。当生命忘却本源，便会招来灭顶之灾。”林婉与秦逸化作的双子星剧烈震颤，星光中浮现出无数古老文明的残片，每一片都记录着因过度追求进化而走向毁灭的悲剧。

循着星光照亮的轨迹，秦溯带领探索小队深入量子海洋。这里的空间呈现出液态水晶质感，无数发光的“生命记忆气泡”漂浮其中，每个气泡都封存着某个文明的诞生与消亡。当他们靠近一片散发着诡异紫光的气泡群时，气泡突然炸裂，释放出数以万计的“基因噬元体”——这些形似dNA双螺旋的机械生物，所到之处，生命体的基因链被迅速拆解吞噬。

“你们终于来了，自以为是的‘守护者’。”气泡中央，一个由数据流组成的人形身影缓缓浮现，他的身体不断切换着各个文明的科技风格，“我是‘归零者’，是所有因进化失控而毁灭的文明怨念聚合体。生命本就不该有高低贵贱之分，唯有归零，才能实现真正的平等！”归零者挥动双手，基因噬元体组成巨大的基因剪刀，朝着宇宙各星系的方向挥去。

自由残缺派与火种重启派的联合舰队在量子海洋中艰难抵抗，但他们的武器攻击只会让基因噬元体产生适应性进化。更糟糕的是，归零者利用部分文明对“完美进化”的执念，煽动他们加入毁灭行列。在“天枢星系”，狂热的进化主义者打开了维度裂缝，企图释放更强大的基因改造武器。