赵刚和李悦对工厂展开秘密调查。他们在工厂废料堆里发现一些碎骨片，经过化验，与之前发现的颅骨属于同一人。正当准备对工厂老板实施抓捕时，工厂老板突然回国自首。他交代，三年前因和一名女性发生争执，失手将其杀害，为毁尸灭迹，对尸体进行了残忍处理。

案件看似就此告破，但赵刚心中始终有个结。在对工厂老板审讯过程中，他发现老板对犯罪细节交代模糊不清，且处理尸体手法与之前推测的凶手精细打磨颅骨的行为不符。

赵刚决定重新梳理案件。他再次回到发现颅骨的现场，仔细观察周围环境。在附近一个废弃房屋角落里，发现了一些奇怪的符号，像是有人用尖锐物品刻下的。这些符号看似毫无规律，但赵刚觉得其中必有深意。

赵刚将这些符号拍照带回警局，和李悦一起研究。李悦突然想起曾在一本关于古代神秘学的书上看到过类似符号，经过查阅资料，发现这些符号与一种古老祭祀仪式有关，而这个祭祀仪式需要用到完整人体骨骼。

赵刚推测，凶手可能是个狂热的神秘学信徒，他的目标或许不止一人，而是要集齐多具人体骨骼完成某种仪式。赵刚和李悦再次对之前筛选出的失踪人口案宗进行深入分析，发现所有失踪者的出生日期竟符合某种特殊的星象排列。

他们顺着这条线索继续调查，发现一个名为“暗影教团”的神秘组织。这个组织在暗网中活跃，宣扬通过古老神秘仪式获得超自然力量。经过一番周折，警方锁定了教团核心成员刘阳，此人是一名资深机械工程师，对精密机械有着极高造诣。

赵刚和李悦带领行动小组迅速出击，在刘阳的秘密据点将其抓获。据点内摆满各种奇怪祭祀用品，墙壁上画满神秘符号，地下室里还存放着多具人体骨骼，其中部分与之前失踪者信息匹配。

面对铁证，刘阳供认不讳。原来，他痴迷于古老神秘学，妄图通过集齐符合特殊星象排列的人体骨骼，举行祭祀仪式，打开所谓“通往超凡力量的大门”。他利用自己在机械加工厂的工作便利，精心挑选目标，残忍杀害后对骨骼进行加工处理。而之前警方调查的工厂老板，不过是刘阳故意安排的替罪羊，他利用工厂老板的心理弱点和犯罪前科，诱导他顶罪。

随着刘阳落网，这起错综复杂的骷髅杀人案终于真相大白。赵刚和李悦凭借着敏锐洞察力、坚韧不拔的毅力和对真相的执着追求，拨开层层迷雾，将隐藏在黑暗中的凶手绳之以法，让受害者得以安息。